Recientemente, la construcción de los laterales de la nave de la Sagrada Familia ha llegado hasta las Escuelas, teniendo que ser "recortada" una de sus esquinas. Al impedir el edificio la continuación de las obras del Templo, fue necesario estudiar posibles soluciones.

Durante las Jornadas Internacionales de Estudios Gaudinistas de 1998 celebradas en Reus, el Dr. Arquitecto y profesor de la Universidad Politécnica de Madrid, Josep Mª Adell, presentó un proyecto de traslado, reubicación y rehabilitación de las Escuelas de Gaudí, para evitar su demolición. En un principio, la propuesta fue aceptada pero en el último año la Junta Constructora decidió que no era viable. Adell proponía convertir el edificio en una barca, cavar un canal de hormigón, llenarlo de agua y trasladar así el edificio.

Al final, los buenos resultados de los estudios y la experiencia de la réplica que el Institut Gaudí de la Construcció estaba realizando en Badalona de forma fidedigna y artesanal, permitieron la elaboración de un proyecto de actuación y traslado para recuperar al máximo el proyecto original de Gaudí muy desvirtuado por las sucesivas reconstrucciones.

La localización actual ha cambiado desplazando el edificio a unos 30 metros y girándolo respecto a su posición inicial. Se han trasladado enteros, con ayuda de grúas, los elementos mejor conservados en grupos de hasta 14 toneladas, entre ellos el cancel y los ángulos donde estaban los servicios. También todos los frontones originales y hasta las piedras del pavimento y de las jardineras que rodeaban la escuela. Incluso se han recuperado 5000 mahones de la época del muro de cerramiento del recinto del Templo y se han limpiado para situarlos en su lugar correspondiente junto a los originales. El interior ha recuperado las vigas vistas de madera y las paredes onduladas que Quintana tapó con tabiques. En el exterior también se han rehecho las gárgolas, desaparecidas, pero documentadas mediante fotografías de época.

Ahora se ofrece el edificio tal y como lo construyó Gaudí con la seguridad de que mantenga plenamente el sistema y la tecnología original.

Desde su traslado, las Escuelas de la Sagrada Familia acogen el aula didáctica del museo, donde se puede contemplar un audiovisual sobre la historia del edificio, y una reproducción del estudio-obrador de Gaudí. Aquí se expondrán originales de maquetas, dibujos y explicaciones de las formas geométricas que el artista incorporó a la arquitectura: conoides, hiperboloides, elipsoides, paraboloides. Será una descripción didáctica del proyecto del arquitecto y se usarán las mismas maquetas y los mismos objetos de los que él se servía.